- Teikia pastabas ir pasiūlymus dėl vadovaujančiosios institucijos rengiamų teisės aktų, reglamentuojančių Investicijų programos administravimo tvarką ir projektų administravimo ir finansavimo tvarką, projektų ir metodinių nurodymų, taip pat teikia pasiūlymus dėl teisės aktų, reglamentuojančių Investicijų programos administravimo tvarką ir projektų administravimo ir finansavimo tvarką, keitimo;
- rengia ir vadovaujančiajai institucijai teikia informaciją apie vykdomas tarpinės institucijos funkcijas, kurios reikia valdymo ir kontrolės sistemos (toliau – VKS) aprašymui parengti;
- teikia pastabas ir pasiūlymus vadovaujančiajai institucijai kuriant ir plėtojant VKS institucijų administracinių gebėjimų ugdymo ir motyvavimo sistemą;
- teikia vadovaujančiajai institucijai ir (ar) administruojančiajai institucijai jų funkcijoms atlikti reikalingą informaciją, susijusią su tarpinės institucijos atliekamomis funkcijomis;
- užtikrina audito seką, saugo gaunamus ir rengiamus dokumentus;
- apie įtariamą pažeidimą įgyvendinant projektą praneša administruojančiajai institucijai;
- įtaręs, kad įgyvendinant projektą buvo padaryta arba gali būti padaryta nusikalstama veika, praneša apie tai institucijoms, atsakingoms už nusikalstamų veikų tyrimus, vadovaujančiajai institucijai ir administruojančiajai institucijai;
- dalyvauja administruojančiajai institucijai įgyvendinant metinius komunikacijos planus;
- nustato bendruomenės inicijuotos vietos plėtros (toliau – BIVP) strategijų atrankos kriterijus, atlieka BIVP strategijų vertinimą;
- rengia ir Jungtiniam vietos plėtros strategijų atrankos komitetui (toliau – Komitetas) teikia miesto vietos plėtros strategijų vertinimo ataskaitas, rengia BIVP strategijų sąrašų projektus;
- vertina BIVP kvietimų teikti vietos plėtros projektų įgyvendinimo planus planą;
- pagal kompetenciją konsultuoja miestų vietos veiklos grupes BIVP strategijų rengimo, įgyvendinimo, priežiūros ir kitais su BIVP susijusiais klausimais;
- skelbia su BIVP strategijų rengimu, įgyvendinimu ir stebėsena susijusią informaciją bei kitą teisės aktų nustatyta tvarka privalomą skelbti informaciją interneto svetainėje miestobendruomene.lt;
- vykdo BIVP strategijų įgyvendinimo priežiūrą, stebėseną ir teikia vietos veiklos grupėms pasiūlymus dėl BIVP strategijų įgyvendinimo tobulinimo;
- rengia ir (ar) dalyvauja rengiant teisės aktų ir kitų dokumentų, susijusių su ES fondų lėšų administravimu, projektus, prireikus inicijuoja ir (ar) atlieka, ir (ar) dalyvauja atliekant minėtų teisės aktų ir kitų dokumentų pakeitimus;
- teisės aktų nustatyta tvarka ir apimtimi vykdo Investicijų programos ES fondų lėšų ir bendrojo finansavimo lėšų planavimo, finansavimo skyrimo projektams, lėšų išmokėjimo projektų vykdytojams, grąžintinų lėšų administravimo procesus ir Veiksmų programos ES fondų lėšų ir Lietuvos Respublikos valstybės biudžeto lėšų išmokėjimo projektų vykdytojams bei grąžintinų lėšų administravimo procesus;
- teisės aktų nustatyta tvarka ir apimtimi atlieka vadovaujančiosios institucijos pavestas užduotis, įgyvendina jos teikiamas rekomendacijas, vadovaujančiosios institucijos prašymu teikia derinti rengiamus teisės aktų ir (ar) dokumentų projektus;
- teisės aktų nustatyta tvarka ir apimtimi teikia informaciją suinteresuotoms institucijoms ir įstaigoms, komitetams, pareiškėjams, projektų vykdytojams, galutiniams naudos gavėjams ir visuomenei, užtikrina bendradarbiavimą su socialiniais ir ekonominiais partneriais įgyvendinant, stebint ir vertinant Investicijų programą;
- vykdo ES fondų lėšomis finansuojamų projektų priežiūrą taip, kad ES fondų lėšos nebūtų prarastos pagal Reglamento (ES) 2021/1060 105 straipsnį ir pagal 2006 m. liepos 11 d. Tarybos reglamento (EB) Nr. 1083/2006, nustatančio bendrąsias nuostatas dėl Europos regioninės plėtros fondo, Europos socialinio fondo ir Sanglaudos fondo bei panaikinančio Reglamentą (EB) Nr. 1260/1999, su paskutiniais pakeitimais, padarytais 2013 m. gruodžio 11 d. Europos Parlamento ir Tarybos reglamentu (ES) Nr. 1297/2013, 93 straipsnio arba pagal 2013 m. gruodžio 17 d. Europos Parlamento ir Tarybos reglamento (ES) Nr. 1303/2013, kuriuo nustatomos Europos regioninės plėtros fondui, Europos socialiniam fondui, Sanglaudos fondui, Europos žemės ūkio fondui kaimo plėtrai ir Europos jūros reikalų ir žuvininkystės fondui bendros nuostatos ir Europos regioninės plėtros fondui, Europos socialiniam fondui, Sanglaudos fondui ir Europos jūros reikalų ir žuvininkystės fondui taikytinos bendrosios nuostatos ir panaikinamas Tarybos reglamentas (EB) Nr. 1083/2006, 136 straipsnio nuostatas ir kad būtų pasiekti Veiksmų programos veiklos peržiūros plane nustatyti rodikliai;
- organizuoja ES fondų lėšų panaudojimo vertinimą;
- dalyvauja administruojant ES fondų investicijų programos interneto svetainę esinvesticijos.lt, rengia, skelbia ir reguliariai atnaujina joje informaciją, skirtą galimiems ir (ar) esamiems pareiškėjams, projektų vykdytojams ir visuomenei;
- dalyvauja kuriant ir plėtojant 2021–2027 metų Europos Sąjungos investicijų administravimo informacinę sistemą (INVESTIS), registruoja joje informaciją apie atliekamus veiksmus;
- koordinuoja integruotų teritorinių investicijų planavimą ir panaudojimą;
- dalyvauja rengiant 2014–2020 metų ES fondų finansavimo laikotarpio užbaigimo dokumentus;
- pagal kompetenciją administruoja techninės paramos lėšas;
- dalyvauja rengiant ministrui priskirtų valdymo sričių ir ministerijos strateginio planavimo dokumentus;
- įgyvendinant ministerijos vidaus kontrolę, užtikrina ministerijos veiklos nuolatinės (kasdienės) stebėsenos atlikimą, rizikos veiksnių nustatymą, rizikos analizę ir vertinimą vidaus reikalų ministrui pavestose valdymo srityse pagal departamentui ir skyriui priskirtas funkcijas;
- atlieka kitas teisės aktuose nustatytas funkcijas, vidaus reikalų ministro, vidaus reikalų viceministro, kuriam priskirta regionų plėtros veiklos sritis, ministerijos kanclerio (toliau – ministerijos vadovybė) ir departamento direktoriaus pavedimus.