- Rengia ir (ar) dalyvauja rengiant teisės aktų ir kitų dokumentų, susijusių su Programų įgyvendinimu ir ES ir bendrojo finansavimo lėšų (toliau kartu – finansavimo lėšos) administravimu, projektus, prireikus inicijuoja ir (ar) atlieka, ir (ar) dalyvauja atliekant minėtų teisės aktų ir kitų dokumentų pakeitimus;
- atlieka įgaliotosios ir tarpinės institucijų priežiūrą ir kontrolę;
- rengia ir Europos Komisijai teikia nacionalinės Vidaus saugumo fondo 2014–2020 m. programos, Sienų valdymo ir vizų politikos finansinės paramos priemonės, įtrauktos į Integruoto sienų valdymo fondą, 2021–2027 m. (toliau – SVVP) programos ir Vidaus saugumo fondo 2021–2027 m. (toliau – VSF) programos (toliau kartu – SVVP ir VSF programos) projektus, prireikus atlieka SVVP ir VSF programų pakeitimus;
- teikia vidaus reikalų ministrui, vidaus reikalų viceministrams ir ministerijos kancleriui (toliau – ministerijos vadovybė) tvirtinti Vidaus saugumo fondo stebėsenos komiteto, SVVP ir VSF programų stebėsenos komiteto (toliau kartu – stebėsenos komitetai) sudėtį, organizuoja jų darbą, atlieka stebėsenos komitetų sekretoriato funkcijas, rengia medžiagą posėdžiams ir (ar) organizuoja jos rengimą, teikia informaciją, reikalingą stebėsenos komitetų funkcijoms atlikti;
- vykdo informavimo ir komunikacijos veiklą, informuojant apie Programų įgyvendinimą, pažangą bei rezultatus ir užtikrinant interneto svetainės https://www.vsfsvvp.lt veikimą;
- konsultuoja suinteresuotas valstybės institucijas, įstaigas ir kitus juridinius asmenis klausimais, susijusiais su finansavimo lėšų gavimu ir projektų, kuriems yra skiriamos finansavimo lėšos, įgyvendinimu;
- derina finansavimo lėšomis finansuojamų projektų sutartis bei jų pakeitimus, rengia sutartis dėl įgaliotajai ir tarpinei institucijoms skiriamos techninės paramos ir jų pakeitimus;
- tikrina įgaliotosios institucijos deklaruotų techninės paramos išlaidų tinkamumą ir teikia įgaliotajai institucijai išvadą dėl išlaidų tinkamumo;
- kaupia, analizuoja ir sistemina finansinę, statistinę informaciją apie finansavimo lėšų investavimą, Programų įgyvendinimą ir atlieka projektų įgyvendinimo ir poprojektinę priežiūrą;
- rengia ir Europos Komisijai teikia metines ir galutinę Vidaus saugumo fondo 2014–2020 m. programos įgyvendinimo ir vertinimo ataskaitas;
- rengia ir Europos Komisijai teikia Vidaus saugumo fondo 2014–2020 m. programos metinio ir galutinio likučio mokėjimo prašymus;
- rengia ir Europos Komisijai teikia SVVP ir VSF programų duomenų ataskaitas, metines veiklos rezultatų ataskaitas ir kitą Europos Komisijos prašomą informaciją;
- rengia SVVP ir VSF programų vertinimo planą, organizuoja SVVP ir VSF programų vertinimus ir Europos Komisijai teikia SVVP ir VSF programų vertinimo ataskaitas;
- rengia ir Europos Komisijai teikia SVVP ir VSF programų mokėjimo paraiškas, metines sąskaitas, valdymo pareiškimus ir prognozes dėl ES įnašo išmokėjimo;
- įtaręs galimą pažeidimą ar sukčiavimą dėl finansavimo lėšų panaudojimo arba gavęs informacijos apie galimą pažeidimą ar sukčiavimą iš kitų šaltinių, šią informaciją praneša atitinkamai įgaliotajai arba tarpinei institucijai;
- priima sprendimus dėl projektų vykdytojų arba, kai išmokamos techninės paramos lėšos, – dėl įgaliotosios ar tarpinės institucijos nepanaudotų ar netinkamai panaudotų finansavimo lėšų grąžinimo ir imasi teisės aktuose nustatytų veiksmų joms susigrąžinti;
- atlieka tyrimą dėl įtariamo pažeidimo ar sukčiavimo dėl įgaliotosios ar tarpinės institucijos techninės paramos lėšų panaudojimo;
- apie nustatytus finansavimo lėšų panaudojimo pažeidimus ir sukčiavimo atvejus praneša Europos Komisijai;
- rengia SVVP ir VSF programų veiklos peržiūros planą ir kartu su tarpine institucija – šio plano rengimo metodiką;
- pagal kompetenciją atlieka programų partnerio funkcijas, numatytas Institucijų, atsakingų už 2014–2021 m. Europos ekonominės erdvės ir Norvegijos finansinių mechanizmų valdymą ir kontrolę Lietuvoje, funkcijų apraše, patvirtintame Lietuvos Respublikos finansų ministro 2018 m. lapkričio 12 d. įsakymu Nr. 1K-389 „Dėl 2014–2021 m. Europos ekonominės erdvės ir Norvegijos finansinių mechanizmų įgyvendinimo Lietuvoje“;
- dalyvauja rengiant ministrui pavestų valdymo sričių ir ministerijos strateginio planavimo dokumentus;
- įgyvendinant ministerijos vidaus kontrolę, užtikrina ministerijos veiklos nuolatinės (kasdienės) stebėsenos atlikimą, rizikos veiksnių nustatymą, rizikos analizę ir vertinimą vidaus reikalų ministrui pavestose valdymo srityse pagal departamentui ir skyriui priskirtas funkcijas;
- atlieka kitas teisės aktuose nustatytas funkcijas, ministerijos vadovybės ir departamento direktoriaus pavedimus.